1) L'endocaridose mitral, ou MVD pour Mitral Valve Disease
L'endocaridose mitral est la première cause de décès prématuré du Cavalier King Charles. Cette race est même étudiée pour cette maladie par les étudiants en médecine vétérinaire! Cette maladie atteint 21 fois plus les Cavaliers King Charles que les autres chiens. Elle provoque une dégénérescence du tissu fibreux de la valve mitrale (cœur gauche), qui sert de « porte » au cœur gauche.
Choisir un éleveur qui effectue ce protocole vous garantie de meilleures chance de garder votre CKC longtemps.
L'éleveur doit donc au minimum :
a) Faire examiner ses chiens annuellement par un vétérinaire cardiologue
b) Sortir de la reproduction tout Cavalier présentant des signe de MVD ( souffle au cœur ) et qui a moins de 5 ans
2) La syringomyélie
Un fois le dépistage fait il faut suivre un protocole rigoureux pour l'élevage .
Pour l'instant ce test aide a la recherche car cette maladie est tres capricieuse . Par contre chez les éleveurs qui test et suivent un protocole rigoureux il ya diminution des symptômes .
Pour l'instant le seul endroit au Canada ou ce test est possible est a London Ontario , et disponible 1 ou 2 fois par années
Voici le protocole que les éleveurs doivent suivre : 
Traduction libre de l’adaptation provenant de : Report from the Chiari-Like Malformation and Syringomyelia Working Group round table. Cappello R, Rusbridge C; Chiari-Like Malformation and Syringomyelia Working Group. Veterinary Surgery (2007) 36 509-12.
L’objectif de ces lignes directrices de sélection consiste à retirer du programme d’élevage les chiens dont la SM est précoce (à noter : Selon l’opinion et l’expérience des auteurs ci-dessus, on croit qu’en raison de la nature complexe de l’héritage de CM/SM, il est toujours possible que la progéniture qui provienne de parents qui ne sont pas ou qui sont seulement légèrement touchés par la SM, puissent tout de même être affectée. (Il s’agit de recommandations et le BVA et le Club Canin n’acceptent aucune responsabilité pour tout résultat de reproduction)
3) Les yeux
Les yeux doivent être auscultés par un ophtalmologiste à tous les ans et avoir une certification ou document prouvant ce suivi.
Le tout dois être certifié par un document OFA ou CHIC
La Kérato-Conjonctivite Sèche est une maladie oculaire qui se soigne bien mais qui peut être invalidante pour le chien si elle n'est pas traitée (perte de la vue et douleurs). Elle est alors contraignante pour le maître parce qu'il faut mettre quotidiennement de l'ocrygel et de l'optimune afin de recréer des larmes artificielles. Au delà de la contrainte, ceci a évidemment un coût ! Cette maladie semble être liée à un problème de "poil frisé" à la naissance.
EFS - Syndrome de Chute Episodique
Le syndrome de chute épisodique est un dysfonctionnement du système nerveux entrainant une dyskinésie involontaire, induite par l’exercice, le stress ou l’excitation et pouvant affecter les quatre membres et le bassin. Ce syndrome est fortement dépendant des facteurs environnementaux (état physique et émotionnel de l'animal). Certains individus homozygotes mutés peuvent ne présenter aucun symptôme. À l’inverse, certains chiens peuvent présenter des symptômes proches de l’EFS, ainsi ce test contribue à un diagnostic différentiel entre cette maladie et différentes formes d'épilepsie. (Source : Antagène)